بنابر شواهد تاریخی نصب ضریح بر مزار امام رضا (ع) از دوره صفویه بوده است و سابقه بیشتر آن معلوم نیست.                                                                                                                                   

ضریح اول :

ضریح چوبی طلا و نقره کوب بوده که در زمان شاه طهماسب صفوی به سال 957 ه.ق ساخته و بر روی صندوق مرقد نصب شده است.                                                                                                                                    

ضریح دوم:

ضریح فولادی مرصع معروف ضریح نگین نشان که در سال 1160 ه.ق ساخته شد واقف آن شاهرخ میرزا نوه نادر شاه افشار بود.                                                                                                                                            

ضریح سوم:

ضریح فولادی ساده ای که در دوره فتحعلی شاه قاجار در سال 1238 ه.ق بر روی ضریح دوم قرار گرفت.             

ضریح چهارم:

ضریح طلا و نقره معروف به شیر و شکر که در سال 1338 ه.ق پس از برداشتن ضریح دوم و انتقال آن به موزه بر روی ضریح نگین نشان (ضریح دوم) نصب گردید .این ضریح زیر نظر استاد مرحوم ابوالحسن حافظیان و توسط استاد هنرمند حاج محمد تقی وذوفن اصفهانی ساخته شده است.این ضریح دارای 4 متر طول و 6/3 متر عرض 9/3 متر ارتفاع است.قسمت بالایی ضریح به سوره های یس و انسان مزین شده است.                                                                                              

ضریح پنجم:

پس از گذشت نیم قرن از عمر ضریح چهام به علت فرسودگی و ساییدگی شبکه های اطراف و روکش های طلایی و نقره ای ضریح،در سال 1372 ه .ش طراحی ضریح پنجم توسط استاد محمود فرشچیان آغاز گردید.این ضریح مقدس با کیفیت ممتاز و در نهایت استحکام به وزن 12تن به ابعاد 73/3 متر در 78/4 متر و ارتفاع 4 متر در 7سال پایان یافت.همچنین سوره های  یس و انسان به خط ثلث با روکش طلا و نقره ،نمای بیرونی ضریح را مزین نموده اند.در چهار سوی این ضریح 14 دهانه (به نشانه 14 معصوم)گل های آفتاب گردان(به نشانه الشموس) گل های هشت پر(به نماد هشتمین امام)و گل های پنج پر(به نشانه پنج تن آل عبا) طرح شده اند.گفتنی است خاتم کاری ،قلم زنی و خطاطی ضریح را اساتید هنر مند چون :کشتی آرای شیرازی،خداداد زاده اصفهانی و استاد موحد بر عهده داشته اند.در تاریخ 21/10/79 ضریح چهارم به دلیل فرسودگی به داخل خزانه حضرت انتقال یافت.ضریح نگین نشان به دلیل موقوفی بودن به طبقه زیرین (سرداب)انتقال یافت.و ضریح پنجم در طبقه بالایی به موازات ضریح دوم نصب گردید در روز 16/12/79 همزمان با عید سعید قربان عملیات نصب ضریح جدید با حضور مقام معظم رهبری پایان یافت.        

سنگ قبر مطهر:

اولین سنگ مزار حضرت که مربوط به سال 516 ه.ق است 40 سانتی متر طول 300 سانتی متر عرض و 6 سانتی متر ارتفاع داشت و دارای کتیبه ای محرابی شکل به خط کوفی شکسته بود که اکنون در موزه نگهداری می شود.دومین سنگ از جنس مرمر سفید و آهک بوده است.سومین سنگ،همین سنگ جدیدی است که در سال 1379 ه.ش نصب گردید.وزن آن 3600 کیلو گرم با عرض 110 سانتی متر و طول 220 سانتی متر و ارتفاع 100 سانتی متر است.در سطح سنگ القاب امام رضا(ع)،تاریخ ولادت و شهادت و دو بیت که حضرت به قصیده ملحق فرمودند حک شده است.اطراف سنگ نیز به آیاتی از قرآن مجید زینت یافته است.